具体方法是，给公司造成的损失从职工本人的工资中扣除，但每月扣除的金额一般不要超过本人月标准工资的百分之二十。如果能够迅速改正错误，表现良好的，赔偿金额可以酌情减少。
法律依据:
《工资支付暂行规定》 第十六条 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣 除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％。若扣除后的剩余工资部 分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
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