自动离职公司不发工资违法。即使是由于劳动者的离职给用人单位造成一定的损失，用人单位可以从员工的工资中扣除一定金额作为对公司的赔偿，但是用人单位在劳动者自动离职不发工资是肯定不合法的。劳动者可以向当地的劳动监察部门对用人单位进行举报，要求用人单位支付相应的工资并对劳动者给予应有的赔偿。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第三十条
用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。
第四十六条
有下列情形之一的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿：
（一）劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的；
（二）用人单位依照本法第三十六条规定向劳动者提出解除劳动合同并与劳动者协商一致解除劳动合同的；
（三）用人单位依照本法第四十条规定解除劳动合同的；
（四）用人单位依照本法第四十一条第一款规定解除劳动合同的；
（五）除用人单位维持或者提高劳动合同约定条件续订劳动合同，劳动者不同意续订的情形外，依照本法第四十四条第一项规定终止固定期限劳动合同的；
（六）依照本法第四十四条第四项、第五项规定终止劳动合同的；
（七）法律、行政法规规定的其他情形。
员工离职工资结算规定有哪些
1、如果劳动者没有依据违法解除劳动合同，用人单位不但不给经济补偿金，劳动者给单位造成损失的要承担赔偿责任，单位可以用扣工资的方法作为赔偿；
2、如果劳动者辞职到期，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
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