申请和办理民事主体资格变更的程序：1、民办学校在提出民事主体资格变更申请前，应当告知债权人、债务人。债权人、债务人对民办学校民事主体资格变更无异议的，民办学校方可向登记管理机关提出变更申请。2、民办学校向我局提交申请民事主体资格变更的全部材料。3、我局对符合民办非企业单位（法人）登记条件的民办学校，发给民办非企业单位（法人）登记证书并在网上进行公告。
法律依据：《中华人民共和国民法典》 第六十四条 法人存续期间登记事项发生变化的，应当依法向登记机关申请变更登记。
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