分子动力学模拟为什么要能量最小化

发布网友 发布时间：2022-04-24 18:17

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热心网友 时间：2023-10-31 05:36

进行能量最小化是因为我们在 PDB 数据库找到蛋白体系有可能包含极度扭 曲， 拉伸或压缩变形的键和角。它们是解析结构同源模建时引入错误曲， 拉伸或压缩变形的键和角。它们是解析结构同源模建时引入错误曲， 拉伸或压缩变形的键和角。它们是解析结构同源模建时引入错误含有很高的能量。如果不首先进行最小化，直接平衡蛋白质会和 含有很高的能量。如果不首先进行最小化，直接平衡蛋白质会和 含有很高的能量。如果不首先进行最小化，直接平衡蛋白质会和 含有很高的能量。如果不首先进行最小化，直接平衡蛋白质会和 水分子 相互作用，恢复伸展状态释放掉这些错误结构中的高能量。一过程是 相互作用，恢复伸展状态释放掉这些错误结构中的高能量。一过程是 相互作用，恢复伸展状态释放掉这些错误结构中的高能量。一过程是 相互作用，恢复伸展状态释放掉这些错误结构中的高能量。一过程是 没有意义的，因为它是错误结构引起反应并不蛋白质在溶液中真实状态。 没有意义的，因为它是错误结构引起反应并不蛋白质在溶液中真实状态。 没有意义的，因为它是错误结构引起反应并不蛋白质在溶液中真实状态。 于是浪费了计算时间。不仅如此，能 量释放引起的剧烈运动和相互作用最终可于是浪费了计算时间。不仅如此，能 量释放引起的剧烈运动和相互作用最终可于是浪费了计算时间。不仅如此，能 量释放引起的剧烈运动和相互作用最终可使得蛋白质的行为不符合溶液中真实。所以有必要在能量平衡之前，首先 使得蛋白质的行为不符合溶液中真实。所以有必要在能量平衡之前，首先 使得蛋白质的行为不符合溶液中真实。所以有必要在能量平衡之前，首先 人为搜索能量最低点，作分子动力学模拟的初始状态。